shiyi18 发表于 2023-10-8 16:52:18

Jason D. Buenrostro 细胞与分子生物学家

Jason D. Buenrostro
细胞与分子生物学家 | 2023 级
开发各种方法和技术,促进我们对基因表达调控机制的了解。



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标题
细胞与分子生物学家
工作单位
哈佛大学干细胞与再生生物学系
工作地点
马萨诸塞州剑桥市
年龄
获奖时 35 岁
研究领域
遗传学和分子生物学
网站
布诺斯特罗实验室
哈佛大学:Jason Buenrostro
布罗德研究所Jason Buenrostro
社交网络
推特
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发表于 2023 年 10 月 4 日
关于杰森的工作
Jason Buenrostro 是一位研究基因表达调控机制的细胞和分子生物学家。他开发了几项新技术,可以更深入、更详细地了解基因是如何以及何时表达或 "开启 "的。要了解基因表达的变异性--不同基因何时、在何种物理环境下以及通过何种机制开启--需要对单个细胞进行详细描述。

作为一名研究生,布诺斯特罗创建了ATAC-seq,这是一种高灵敏度、高精确度的方法,用于识别基因组中开放或可访问的表达区域。ATAC-seq能识别染色质(一种由DNA和蛋白质组成的复合物,能将遗传物质包装成紧凑的结构)在哪些地方使DNA部分可用于转录,转录是将DNA信息复制到信使RNA并传送到细胞蛋白质制造机制的过程。与其他方法相比,ATAC-seq 更容易使用,成本更低,已成为染色质可及性研究的标准工具。与其他方法相比,ATAC-seq 所需的细胞数量更少,因此研究人员可以使用单个患者的实际细胞样本,并提高了对罕见细胞亚型的检测能力。Buenrostro 利用可编程微流控技术扩展了这一平台,以分析单细胞的染色质可及性。Buenrostro 及其同事利用单细胞 ATAC-seq 追踪人类血细胞形成过程中染色质可及性的变化,并确定调控血细胞发育和疾病的特定转录因子。他接着开发了SHARE-seq,该技术可同时鉴定同一单细胞中的DNA可及性和基因表达。利用SHARE-seq和创新的计算方法,Buenrostro和他的合作者确定了可访问染色质的某些区域与决定细胞系或细胞将成为哪种类型的特化组织或器官的基因相关。他们随后证明,对这些调控染色质可访问区域的测量可用于在转录前预测细胞系选择。

最近,布诺斯特罗开发了DNA测序方法,以更好地了解空间环境如何影响细胞功能。将细胞保持在组织内的原始位置,可以研究不同类型的细胞如何影响周围的细胞。布诺斯特罗及其同事开发的滑动DNA-测序技术能确定基因突变的空间位置。在癌症肿瘤方面,滑动DNA-seq能让研究人员更好地了解癌细胞独特的进化途径和潜在的治疗方法。通过工具开发和自己的研究,布诺斯特罗使研究人员更接近于破译细胞发育和细胞功能的关键遗传机制,并了解它们对健康的影响。

简历
Jason Buenrostro 2009 年获得圣克拉拉大学学士学位,2016 年获得斯坦福大学博士学位。随后,他成为哈佛大学哈佛研究员协会初级研究员以及布罗德研究所研究员(2016-2018 年)。布恩罗斯特罗目前是哈佛大学干细胞与再生生物学系副教授,以及麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所成员(2018 年至今)。他曾在《科学》、《自然》、《细胞》、《自然遗传学》和《美国国家科学院院刊》等多家权威期刊上发表文章。
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